Yra daug ginčų dėl intelektualių šunų sugebėjimų. Tačiau šuns protas dar nebuvo ištirtas pakankamai, kad pagrįstai paaiškintų tam tikrus jų elgesio momentus. Įvairių tyrimų ir stebėjimų metu buvo atskleista, kurios šunų veislės yra protingesnės, kaip šunys reaguoja į įvairias situacijas, kaip jie vysto refleksus prie stimulų. Tačiau verta manyti, kad labiausiai pažengusių šunų reitingas priklauso nuo kriterijų, pagal kurį nustatomi jų sugebėjimai. Pavyzdžiui, jei pagrindinis kriterijus yra gebėjimas mokytis, tada geriausius protingus šunis vadovauja pasienio koliai, kuriuos lengva mokyti. Šunys veisia Border Collie, galinčią dirbti tiek kaip saugos šunį, tiek kaip auklės. Antroji vieta šiame sąraše yra pudelis, po kurio eina vokiečių aviganas. Tuo pačiu metu tokia protinga šunų veislė, kaip Chow Chow, užima tik 75 vietą, nepaisant to, kad šie šunys turi labai išvystytus intelektualinius sugebėjimus. Žemas reitingo taškas yra dėl to, kad chow komandos neįgyvendins, nebent tai bus būtina. Tas pats pasakytina ir apie Kaukazo aviganius, kai kai kurių komandų mokymas net neveikia. Pavyzdžiui, Kaukazo aviganis nebus apgynęs magistro iš fronto užpuoliko. Ji puikiai supranta, kad nėra jokios grėsmės, tačiau, jei ji sugeba ją perdaryti, ir ji mano, kad išpuolis yra tikras, tada užpuolikas bus labai pavojingas, nes šuo elgiasi nenuspėjamai tokiose situacijose. Tas pats pasakytina apie Laikas. Jie veikia pagal situaciją ir gali būti nepaklusnūs. Toks elgesys nenurodo žemo lygio intelekto. Ilgą laiką huskiai buvo žmonės, esantys šiaurinėje sudėtingoje situacijoje. Pavyzdžiui, žmonės turėjo daugiausia pasikliauti savo šunų išraiškomis, kvapu ir klausa, pavyzdžiui, šunys į pakinktus galėjo sustabdyti arba visiškai paimti kapitoną kitoje kryptyje, jei jie jautė pavoją, pavyzdžiui, įtrūkimus leduose. Taigi, jie suformavo tam tikrą santykių su žmogumi supratimą, aklas prigimtis nėra būdinga šiai veislei, tačiau jų sugebėjimas priimti savo sprendimus ir veikti tam tikroje situacijoje reikalauja labai didelių intelektualinių gebėjimų.
Kiekviena veislė šuns buvo veisiami arba prijaukinti žmogui tam tikrais tikslais, todėl sunku nustatyti, kuri veislė yra protingiausia. Pavyzdžiui, net protingiausias šuo, išvestas į apsaugą, negali būti naudingas medžioklei, o šuns kompanionas, kuris supranta savo šeimininką iš pusės žodžio, žino daug komandų, negali bandyti ar tinkamai saugoti teritoriją. Štai kodėl neįmanoma nustatyti pačios protingiausios šunų veislės. Taip pat neįmanoma nustatyti, kas yra protingesnis už katę ar šunį. Katės visiškai skirtingai prisitaiko aplinkoje, galvoja kitaip ir suvokia informaciją. Be to, katė nieko neprieštaraus norui, net jei supras, ko tai reikalinga. Protingas šuo taip pat negali vykdyti komandų, kurių jis nemano esant tinkamais, bet vis tiek jo elgesį ir požiūrį
Be tam tikros veislės būdingų sugebėjimų, daug priklauso nuo išsilavinimo ir nuo paveldėjimo. Net protingiausias šuo, jei jis neteisingai išsilavinęs, gali prarasti savo savybes. Pavyzdžiui, labradoro retriveris laikomas subalansuotu ir lengvai išmokytu šuniu, kuris naudojamas kaip gidų šunys gelbėjimo ir policijos tarnyboms. Su tokiu pranašumų sąrašu labradorai užima pirmąją vietą atakų žmonėms statistikoje. Šis paradoksas paaiškinamas tuo, kad, tikėdamiesi veislės kokybei, savininkai nepripažino švietimo, dėl kurio kilo nepaklusnumas ir agresija. Jei prieš įsigydami šuniuką būsimi savininkai tiksliai žinotų, kokias savybes turi turėti savo augintinis, kiek laiko jie gali skirti mokymui, kokį auklėjimą ir slaugymą šuniui reikia, tada jie galės pasirinkti tinkamą veislę ir auginti labai protingą šunį.